SUPER JUNIOR - 2008 - 2009 (SORRY, SORRY, SS1, SS2)
2008 áprilisában megalakult a Super Junior - M, a zenekar harmadik hivatalos alcsoportja. A csoport a mandarin (kinai) nyelvű dalokra szakosodott, többek között a Super Junior koreai számainak fordítására, hogy ezzel is népszerűsítsék az együttest, a kínai zeneiparban. Az együttes nevében az M, mandarint jelöl. A Super Junior-M az első nemzetközi csoport, amiben koreai és kínai származású tagok is vannak. A Super Junior - M az egyik legsikeresebb alcsoport Kínában. Számos díjat nyertek, és elismerést a Super Girl c. kislemezük megjelenése után.
A zenekar tagjai (2008-2009): Kyuhyun, Hangeng, Donghae, Siwon, Ryeowook, és két tag akik csak ebben az alcsoportban tagok, a Super Junior-nak nem tagjai, Zhoumi és Henry.
A zenekar tagjai (2011-napjainkig): Kyuhyun, Donghae, Siwon, Ryeowook, Eunhyuk, Sungmin, és két tag akik csak ebben az alcsoportban tagok, a Super Junior-nak nem tagjai, Zhoumi és Henry.
Nemsokkal a SUJU-M után, megalakult egy újabb alcsoport, a Super Junior - H. A 'H' betű, Happy-t jelent. Hat tag alkotja, Leeteuk, Yesung, Kangin, Shindong, Sungmin, és Eunhyuk. A csoportnak 2008-ban jelent meg két kislemeze, Cooking? Cooking! és Pajama Party címmel.
2008. február 22-én útjára indult az első Super Show, a SUJU ázsiai koncert turnéja. A banda kiadta a U és a Twins c. dalok japán verzióját, ami hatalmas sikert aratott Japánban.
A SJ 2009. március 12-én kiadta harmadik stúdió albumát Sorry, Sorry címmel. Az első nap 29.000 példányban kelt el. Egy hónappal a megjelenés után, az album Dél-Korea legkeresettebb albuma lett 2009-ben, és végül 250.000 példányt adtak el belőle. A Sorry, Sorry hazai és nemzetközi elismeréseket is szerzett, beleértve az Év Albuma címet is.
A Sorry, Sorry sikere után, 2009. július 17-én elindult a Super Show 2, a zenekar második ázsiai koncertturnéja.